国有土地使用证和集体土地使用证的发证、办理部门是有区别的，所以下面就分别介绍一下。

（一）国有土地土地使用证的办理：

1.单位和个人依法使用的国有土地，由土地使用者向土地所在地的县级以上人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级以上人民政府登记造册，核发国有土地使用权证书，确认使用权。
2.中央国家机关使用的国有土地的登记发证，由国务院土地行政主管部门负责，具体登记发证办法由国务院土地行政主管部门会同国务院机关事务管理局等有关部门制定。

（二）集体土地土地使用证的办理：

1.农民集体所有的土地，由土地所有者向土地所在地的县级人民政府土地行政主管部门提出土地登记申请，由县级人民政府登记造册，核发集体土地所有权证书，确认所有权。

2.用于非农业建设的土地的土地使用证，要向所在地的县级人民政府土地行政主管部门申请登记，审批通过后在有当地的人民政府核发集体土地的使用用权证书。